Los órganos de Gobierno de Ahosgal, según establecen sus estatutos, están compuestos por:
La Asamblea. Es el órgano supremo de la organización y forman parte de ella todos sus socios. Los acuerdos se aprobarán por mayoría simple de los asociados presentes o representados con derecho a voto, excepto para la modificación de los estatutos o la disolución, que requerirá la mayoría cualificada de dos tercios.
Junta Directiva. Es el órgano permanente de gobierno, dirección y administración de la Asociación y esta compuesta por el presidente, el vicepresidente y el secretario. Le corresponde la adopción de los acuerdos que proceda en relación a la representación, gestión y defensa de los intereses profesionales de los socios.
Presidente. Tiene las funciones de representar legalmente a la Asociación. Convocar, presidir y levantar las sesiones que celebren la Asamblea General y la Junta Directiva; dirigiendo las mismas y disponiendo voto de calidad en caso de empate.
Director Gerente. Ejerce la dirección profesional de la organización, labores de representación ante las instituciones públicas y privadas. También desempeña la planificación y ejecución de estrategias comunes que beneficien a los hospitales de la Asociación. Asistirá con voz pero sin voto a todas las reuniones que celebren tanto la Asamblea como la Junta Directiva.